Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ufl1Q8CCJ3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ufl1Q8CCJ3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ufl1Q8CCJ3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ufl1Q8CCJ3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ufl1Q8CCJ3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ufl1Q8CCJ3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ufl1Q8CCJ3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ufl1Q8CCJ3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ufl1Q8CCJ3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ufl1Q8CCJ3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ufl1Q8CCJ3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ufl1Q8CCJ3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ufl1Q8CCJ3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ufl1Q8CCJ3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ufl1Q8CCJ3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ufl1Q8CCJ3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ufl1Q8CCJ3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ufl1Q8CCJ3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ufl1Q8CCJ3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ufl1Q8CCJ3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ufl1Q8CCJ3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ufl1Q8CCJ3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ufl1Q8CCJ3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ufl1Q8CCJ3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ufl1Q8CCJ3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ufl1Q8CCJ3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ufl1Q8CCJ3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ufl1Q8CCJ3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ufl1Q8CCJ3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ufl1Q8CCJ3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ufl1Q8CCJ3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ufl1Q8CCJ3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ufl1Q8CCJ3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ufl1Q8CCJ3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ufl1Q8CCJ3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ufl1Q8CCJ3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ufl1Q8CCJ3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ufl1Q8CCJ3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ufl1Q8CCJ3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ufl1Q8CCJ3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ufl1Q8CCJ3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ufl1Q8CCJ3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ufl1Q8CCJ3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ufl1Q8CCJ3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ufl1Q8CCJ3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ufl1Q8CCJ3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ufl1Q8CCJ3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ufl1Q8CCJ3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ufl1Q8CCJ3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ufl1Q8CCJ3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ufl1Q8CCJ3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ufl1Q8CCJ3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ufl1Q8CCJ3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ufl1Q8CCJ3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ufl1Q8CCJ3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ufl1Q8CCJ3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ufl1Q8CCJ3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ufl1Q8CCJ3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ufl1Q8CCJ3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ufl1Q8CCJ3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ufl1Q8CCJ3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ufl1Q8CCJ3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ufl1Q8CCJ3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ufl1Q8CCJ3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ufl1Q8CCJ3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ufl1Q8CCJ3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ufl1Q8CCJ3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
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