Protein–RNA interactions for Protein: Q8C850

Scara3, Scavenger receptor class A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara3Q8C850 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scara3Q8C850 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scara3Q8C850 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scara3Q8C850 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Scara3Q8C850 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scara3Q8C850 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scara3Q8C850 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scara3Q8C850 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scara3Q8C850 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scara3Q8C850 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scara3Q8C850 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scara3Q8C850 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scara3Q8C850 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scara3Q8C850 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scara3Q8C850 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scara3Q8C850 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scara3Q8C850 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scara3Q8C850 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scara3Q8C850 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scara3Q8C850 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scara3Q8C850 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scara3Q8C850 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scara3Q8C850 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scara3Q8C850 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Scara3Q8C850 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scara3Q8C850 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scara3Q8C850 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scara3Q8C850 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scara3Q8C850 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scara3Q8C850 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scara3Q8C850 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Scara3Q8C850 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scara3Q8C850 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scara3Q8C850 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scara3Q8C850 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scara3Q8C850 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scara3Q8C850 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scara3Q8C850 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Scara3Q8C850 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scara3Q8C850 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scara3Q8C850 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scara3Q8C850 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scara3Q8C850 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Scara3Q8C850 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms