Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apoa5Q8C7G5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apoa5Q8C7G5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apoa5Q8C7G5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apoa5Q8C7G5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apoa5Q8C7G5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apoa5Q8C7G5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apoa5Q8C7G5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Apoa5Q8C7G5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apoa5Q8C7G5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apoa5Q8C7G5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoa5Q8C7G5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apoa5Q8C7G5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apoa5Q8C7G5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apoa5Q8C7G5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apoa5Q8C7G5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apoa5Q8C7G5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Apoa5Q8C7G5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apoa5Q8C7G5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apoa5Q8C7G5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apoa5Q8C7G5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apoa5Q8C7G5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Apoa5Q8C7G5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apoa5Q8C7G5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoa5Q8C7G5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoa5Q8C7G5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoa5Q8C7G5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoa5Q8C7G5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoa5Q8C7G5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoa5Q8C7G5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apoa5Q8C7G5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Apoa5Q8C7G5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apoa5Q8C7G5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms