Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Csgalnact2Q8C1F4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Csgalnact2Q8C1F4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Csgalnact2Q8C1F4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Csgalnact2Q8C1F4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Csgalnact2Q8C1F4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Csgalnact2Q8C1F4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Csgalnact2Q8C1F4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Csgalnact2Q8C1F4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Csgalnact2Q8C1F4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Csgalnact2Q8C1F4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Csgalnact2Q8C1F4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Csgalnact2Q8C1F4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Csgalnact2Q8C1F4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Csgalnact2Q8C1F4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Csgalnact2Q8C1F4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Csgalnact2Q8C1F4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Csgalnact2Q8C1F4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Csgalnact2Q8C1F4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Csgalnact2Q8C1F4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Csgalnact2Q8C1F4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Csgalnact2Q8C1F4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Csgalnact2Q8C1F4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Csgalnact2Q8C1F4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Csgalnact2Q8C1F4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Csgalnact2Q8C1F4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Csgalnact2Q8C1F4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Csgalnact2Q8C1F4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Csgalnact2Q8C1F4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Csgalnact2Q8C1F4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Csgalnact2Q8C1F4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Csgalnact2Q8C1F4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Csgalnact2Q8C1F4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Csgalnact2Q8C1F4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Csgalnact2Q8C1F4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Csgalnact2Q8C1F4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Csgalnact2Q8C1F4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Csgalnact2Q8C1F4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Csgalnact2Q8C1F4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Csgalnact2Q8C1F4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Csgalnact2Q8C1F4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Csgalnact2Q8C1F4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Csgalnact2Q8C1F4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Csgalnact2Q8C1F4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Csgalnact2Q8C1F4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Csgalnact2Q8C1F4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Csgalnact2Q8C1F4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Csgalnact2Q8C1F4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Csgalnact2Q8C1F4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Csgalnact2Q8C1F4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms