Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY89

Slc44a2, Choline transporter-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a2Q8BY89 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc44a2Q8BY89 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc44a2Q8BY89 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc44a2Q8BY89 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a2Q8BY89 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms