Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn17Q8BXA6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn17Q8BXA6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn17Q8BXA6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn17Q8BXA6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn17Q8BXA6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn17Q8BXA6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn17Q8BXA6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn17Q8BXA6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn17Q8BXA6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn17Q8BXA6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn17Q8BXA6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn17Q8BXA6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn17Q8BXA6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn17Q8BXA6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn17Q8BXA6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn17Q8BXA6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn17Q8BXA6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn17Q8BXA6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn17Q8BXA6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn17Q8BXA6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn17Q8BXA6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn17Q8BXA6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn17Q8BXA6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn17Q8BXA6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn17Q8BXA6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn17Q8BXA6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn17Q8BXA6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn17Q8BXA6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn17Q8BXA6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn17Q8BXA6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn17Q8BXA6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn17Q8BXA6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn17Q8BXA6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn17Q8BXA6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn17Q8BXA6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn17Q8BXA6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn17Q8BXA6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn17Q8BXA6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn17Q8BXA6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn17Q8BXA6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn17Q8BXA6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn17Q8BXA6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn17Q8BXA6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn17Q8BXA6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn17Q8BXA6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn17Q8BXA6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn17Q8BXA6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn17Q8BXA6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn17Q8BXA6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn17Q8BXA6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn17Q8BXA6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn17Q8BXA6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn17Q8BXA6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn17Q8BXA6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn17Q8BXA6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn17Q8BXA6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn17Q8BXA6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cldn17Q8BXA6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn17Q8BXA6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn17Q8BXA6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn17Q8BXA6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn17Q8BXA6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn17Q8BXA6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn17Q8BXA6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn17Q8BXA6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn17Q8BXA6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn17Q8BXA6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn17Q8BXA6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn17Q8BXA6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn17Q8BXA6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn17Q8BXA6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn17Q8BXA6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn17Q8BXA6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn17Q8BXA6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn17Q8BXA6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn17Q8BXA6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn17Q8BXA6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn17Q8BXA6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn17Q8BXA6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn17Q8BXA6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn17Q8BXA6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn17Q8BXA6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn17Q8BXA6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn17Q8BXA6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn17Q8BXA6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn17Q8BXA6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn17Q8BXA6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn17Q8BXA6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn17Q8BXA6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn17Q8BXA6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn17Q8BXA6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn17Q8BXA6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn17Q8BXA6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn17Q8BXA6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn17Q8BXA6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn17Q8BXA6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn17Q8BXA6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn17Q8BXA6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn17Q8BXA6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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