Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp38Q8BW70 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp38Q8BW70 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp38Q8BW70 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp38Q8BW70 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp38Q8BW70 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp38Q8BW70 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp38Q8BW70 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp38Q8BW70 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp38Q8BW70 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp38Q8BW70 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp38Q8BW70 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp38Q8BW70 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp38Q8BW70 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp38Q8BW70 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp38Q8BW70 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp38Q8BW70 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp38Q8BW70 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp38Q8BW70 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp38Q8BW70 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp38Q8BW70 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp38Q8BW70 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp38Q8BW70 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp38Q8BW70 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp38Q8BW70 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp38Q8BW70 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp38Q8BW70 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp38Q8BW70 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp38Q8BW70 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp38Q8BW70 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp38Q8BW70 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp38Q8BW70 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp38Q8BW70 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp38Q8BW70 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp38Q8BW70 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp38Q8BW70 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp38Q8BW70 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp38Q8BW70 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp38Q8BW70 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp38Q8BW70 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp38Q8BW70 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Usp38Q8BW70 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp38Q8BW70 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp38Q8BW70 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp38Q8BW70 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp38Q8BW70 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp38Q8BW70 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp38Q8BW70 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp38Q8BW70 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp38Q8BW70 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp38Q8BW70 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp38Q8BW70 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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