Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Als2cr12Q8BVM7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Als2cr12Q8BVM7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Als2cr12Q8BVM7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Als2cr12Q8BVM7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Als2cr12Q8BVM7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Als2cr12Q8BVM7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Als2cr12Q8BVM7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Als2cr12Q8BVM7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Als2cr12Q8BVM7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Als2cr12Q8BVM7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Als2cr12Q8BVM7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Als2cr12Q8BVM7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Als2cr12Q8BVM7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Als2cr12Q8BVM7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Als2cr12Q8BVM7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Als2cr12Q8BVM7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Als2cr12Q8BVM7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Als2cr12Q8BVM7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Als2cr12Q8BVM7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Als2cr12Q8BVM7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Als2cr12Q8BVM7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Als2cr12Q8BVM7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Als2cr12Q8BVM7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Als2cr12Q8BVM7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Als2cr12Q8BVM7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Als2cr12Q8BVM7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Als2cr12Q8BVM7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Als2cr12Q8BVM7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Als2cr12Q8BVM7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Als2cr12Q8BVM7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Als2cr12Q8BVM7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms