Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pggt1bQ8BUY9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pggt1bQ8BUY9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pggt1bQ8BUY9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pggt1bQ8BUY9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pggt1bQ8BUY9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pggt1bQ8BUY9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pggt1bQ8BUY9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pggt1bQ8BUY9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pggt1bQ8BUY9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pggt1bQ8BUY9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pggt1bQ8BUY9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pggt1bQ8BUY9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pggt1bQ8BUY9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pggt1bQ8BUY9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pggt1bQ8BUY9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pggt1bQ8BUY9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pggt1bQ8BUY9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pggt1bQ8BUY9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pggt1bQ8BUY9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pggt1bQ8BUY9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pggt1bQ8BUY9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pggt1bQ8BUY9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pggt1bQ8BUY9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pggt1bQ8BUY9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pggt1bQ8BUY9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pggt1bQ8BUY9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pggt1bQ8BUY9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pggt1bQ8BUY9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pggt1bQ8BUY9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pggt1bQ8BUY9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pggt1bQ8BUY9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pggt1bQ8BUY9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pggt1bQ8BUY9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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