Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP56

Pgghg, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgghgQ8BP56 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PgghgQ8BP56 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PgghgQ8BP56 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PgghgQ8BP56 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PgghgQ8BP56 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PgghgQ8BP56 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PgghgQ8BP56 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PgghgQ8BP56 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PgghgQ8BP56 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PgghgQ8BP56 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PgghgQ8BP56 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PgghgQ8BP56 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PgghgQ8BP56 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PgghgQ8BP56 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PgghgQ8BP56 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PgghgQ8BP56 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PgghgQ8BP56 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PgghgQ8BP56 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PgghgQ8BP56 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PgghgQ8BP56 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PgghgQ8BP56 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PgghgQ8BP56 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PgghgQ8BP56 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PgghgQ8BP56 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PgghgQ8BP56 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PgghgQ8BP56 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PgghgQ8BP56 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PgghgQ8BP56 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PgghgQ8BP56 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PgghgQ8BP56 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PgghgQ8BP56 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PgghgQ8BP56 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PgghgQ8BP56 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PgghgQ8BP56 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PgghgQ8BP56 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PgghgQ8BP56 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PgghgQ8BP56 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PgghgQ8BP56 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PgghgQ8BP56 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PgghgQ8BP56 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PgghgQ8BP56 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PgghgQ8BP56 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PgghgQ8BP56 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PgghgQ8BP56 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PgghgQ8BP56 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PgghgQ8BP56 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PgghgQ8BP56 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PgghgQ8BP56 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PgghgQ8BP56 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms