Protein–RNA interactions for Protein: Q8BN58

Arhgap28, Rho GTPase-activating protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap28Q8BN58 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgap28Q8BN58 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Arhgap28Q8BN58 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arhgap28Q8BN58 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgap28Q8BN58 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arhgap28Q8BN58 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgap28Q8BN58 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgap28Q8BN58 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap28Q8BN58 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap28Q8BN58 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap28Q8BN58 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgap28Q8BN58 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgap28Q8BN58 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgap28Q8BN58 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgap28Q8BN58 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap28Q8BN58 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgap28Q8BN58 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap28Q8BN58 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap28Q8BN58 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap28Q8BN58 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgap28Q8BN58 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgap28Q8BN58 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Arhgap28Q8BN58 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgap28Q8BN58 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgap28Q8BN58 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgap28Q8BN58 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgap28Q8BN58 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgap28Q8BN58 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgap28Q8BN58 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgap28Q8BN58 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgap28Q8BN58 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgap28Q8BN58 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgap28Q8BN58 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arhgap28Q8BN58 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arhgap28Q8BN58 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arhgap28Q8BN58 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arhgap28Q8BN58 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgap28Q8BN58 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgap28Q8BN58 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgap28Q8BN58 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgap28Q8BN58 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms