Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gga3Q8BMI3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gga3Q8BMI3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gga3Q8BMI3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gga3Q8BMI3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gga3Q8BMI3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gga3Q8BMI3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gga3Q8BMI3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Gga3Q8BMI3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gga3Q8BMI3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gga3Q8BMI3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gga3Q8BMI3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gga3Q8BMI3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Gga3Q8BMI3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gga3Q8BMI3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gga3Q8BMI3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gga3Q8BMI3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gga3Q8BMI3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gga3Q8BMI3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gga3Q8BMI3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gga3Q8BMI3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Gga3Q8BMI3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gga3Q8BMI3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gga3Q8BMI3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gga3Q8BMI3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gga3Q8BMI3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gga3Q8BMI3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Gga3Q8BMI3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gga3Q8BMI3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gga3Q8BMI3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gga3Q8BMI3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gga3Q8BMI3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gga3Q8BMI3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gga3Q8BMI3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gga3Q8BMI3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gga3Q8BMI3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gga3Q8BMI3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gga3Q8BMI3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gga3Q8BMI3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gga3Q8BMI3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gga3Q8BMI3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gga3Q8BMI3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gga3Q8BMI3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gga3Q8BMI3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gga3Q8BMI3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gga3Q8BMI3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gga3Q8BMI3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gga3Q8BMI3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gga3Q8BMI3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gga3Q8BMI3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gga3Q8BMI3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gga3Q8BMI3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gga3Q8BMI3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gga3Q8BMI3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gga3Q8BMI3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gga3Q8BMI3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gga3Q8BMI3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gga3Q8BMI3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gga3Q8BMI3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gga3Q8BMI3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gga3Q8BMI3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gga3Q8BMI3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gga3Q8BMI3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gga3Q8BMI3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gga3Q8BMI3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gga3Q8BMI3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gga3Q8BMI3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gga3Q8BMI3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gga3Q8BMI3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gga3Q8BMI3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gga3Q8BMI3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gga3Q8BMI3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gga3Q8BMI3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gga3Q8BMI3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gga3Q8BMI3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gga3Q8BMI3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gga3Q8BMI3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gga3Q8BMI3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Gga3Q8BMI3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gga3Q8BMI3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gga3Q8BMI3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gga3Q8BMI3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gga3Q8BMI3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gga3Q8BMI3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gga3Q8BMI3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gga3Q8BMI3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gga3Q8BMI3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gga3Q8BMI3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gga3Q8BMI3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gga3Q8BMI3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gga3Q8BMI3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gga3Q8BMI3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gga3Q8BMI3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gga3Q8BMI3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gga3Q8BMI3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gga3Q8BMI3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gga3Q8BMI3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gga3Q8BMI3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gga3Q8BMI3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gga3Q8BMI3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms