Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLE7

Slc17a6, Vesicular glutamate transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a6Q8BLE7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc17a6Q8BLE7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc17a6Q8BLE7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc17a6Q8BLE7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc17a6Q8BLE7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc17a6Q8BLE7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a6Q8BLE7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a6Q8BLE7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a6Q8BLE7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc17a6Q8BLE7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc17a6Q8BLE7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc17a6Q8BLE7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc17a6Q8BLE7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc17a6Q8BLE7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc17a6Q8BLE7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc17a6Q8BLE7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc17a6Q8BLE7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc17a6Q8BLE7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc17a6Q8BLE7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc17a6Q8BLE7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc17a6Q8BLE7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a6Q8BLE7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc17a6Q8BLE7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc17a6Q8BLE7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc17a6Q8BLE7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc17a6Q8BLE7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc17a6Q8BLE7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc17a6Q8BLE7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc17a6Q8BLE7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc17a6Q8BLE7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc17a6Q8BLE7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc17a6Q8BLE7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc17a6Q8BLE7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc17a6Q8BLE7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc17a6Q8BLE7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc17a6Q8BLE7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc17a6Q8BLE7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc17a6Q8BLE7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc17a6Q8BLE7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc17a6Q8BLE7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc17a6Q8BLE7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc17a6Q8BLE7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc17a6Q8BLE7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc17a6Q8BLE7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc17a6Q8BLE7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc17a6Q8BLE7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc17a6Q8BLE7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc17a6Q8BLE7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc17a6Q8BLE7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms