Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLD6

Ankrd55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd55Q8BLD6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ankrd55Q8BLD6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd55Q8BLD6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd55Q8BLD6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd55Q8BLD6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd55Q8BLD6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd55Q8BLD6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd55Q8BLD6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd55Q8BLD6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd55Q8BLD6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd55Q8BLD6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd55Q8BLD6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd55Q8BLD6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd55Q8BLD6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd55Q8BLD6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd55Q8BLD6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ankrd55Q8BLD6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ankrd55Q8BLD6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ankrd55Q8BLD6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ankrd55Q8BLD6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ankrd55Q8BLD6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ankrd55Q8BLD6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ankrd55Q8BLD6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ankrd55Q8BLD6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ankrd55Q8BLD6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ankrd55Q8BLD6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ankrd55Q8BLD6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ankrd55Q8BLD6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd55Q8BLD6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd55Q8BLD6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd55Q8BLD6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ankrd55Q8BLD6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd55Q8BLD6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ankrd55Q8BLD6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ankrd55Q8BLD6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd55Q8BLD6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms