Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
U2af1l4Q8BGJ9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
U2af1l4Q8BGJ9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
U2af1l4Q8BGJ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
U2af1l4Q8BGJ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2af1l4Q8BGJ9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2af1l4Q8BGJ9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
U2af1l4Q8BGJ9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2af1l4Q8BGJ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
U2af1l4Q8BGJ9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
U2af1l4Q8BGJ9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
U2af1l4Q8BGJ9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
U2af1l4Q8BGJ9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
U2af1l4Q8BGJ9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
U2af1l4Q8BGJ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
U2af1l4Q8BGJ9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2af1l4Q8BGJ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2af1l4Q8BGJ9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
U2af1l4Q8BGJ9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
U2af1l4Q8BGJ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
U2af1l4Q8BGJ9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
U2af1l4Q8BGJ9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2af1l4Q8BGJ9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2af1l4Q8BGJ9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
U2af1l4Q8BGJ9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2af1l4Q8BGJ9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2af1l4Q8BGJ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
U2af1l4Q8BGJ9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2af1l4Q8BGJ9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2af1l4Q8BGJ9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2af1l4Q8BGJ9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
U2af1l4Q8BGJ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2af1l4Q8BGJ9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2af1l4Q8BGJ9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
U2af1l4Q8BGJ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2af1l4Q8BGJ9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2af1l4Q8BGJ9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
U2af1l4Q8BGJ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
U2af1l4Q8BGJ9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
U2af1l4Q8BGJ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
U2af1l4Q8BGJ9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2af1l4Q8BGJ9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
U2af1l4Q8BGJ9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
U2af1l4Q8BGJ9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2af1l4Q8BGJ9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2af1l4Q8BGJ9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2af1l4Q8BGJ9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2af1l4Q8BGJ9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
U2af1l4Q8BGJ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2af1l4Q8BGJ9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2af1l4Q8BGJ9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2af1l4Q8BGJ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2af1l4Q8BGJ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
U2af1l4Q8BGJ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
U2af1l4Q8BGJ9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2af1l4Q8BGJ9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2af1l4Q8BGJ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
U2af1l4Q8BGJ9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
U2af1l4Q8BGJ9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2af1l4Q8BGJ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
U2af1l4Q8BGJ9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
U2af1l4Q8BGJ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
U2af1l4Q8BGJ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2af1l4Q8BGJ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
U2af1l4Q8BGJ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
U2af1l4Q8BGJ9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2af1l4Q8BGJ9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2af1l4Q8BGJ9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2af1l4Q8BGJ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
U2af1l4Q8BGJ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
U2af1l4Q8BGJ9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2af1l4Q8BGJ9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms