Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pknox2Q8BG99 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pknox2Q8BG99 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pknox2Q8BG99 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Pknox2Q8BG99 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pknox2Q8BG99 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pknox2Q8BG99 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pknox2Q8BG99 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pknox2Q8BG99 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pknox2Q8BG99 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pknox2Q8BG99 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pknox2Q8BG99 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pknox2Q8BG99 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pknox2Q8BG99 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pknox2Q8BG99 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pknox2Q8BG99 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pknox2Q8BG99 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pknox2Q8BG99 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pknox2Q8BG99 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pknox2Q8BG99 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pknox2Q8BG99 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pknox2Q8BG99 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pknox2Q8BG99 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pknox2Q8BG99 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pknox2Q8BG99 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pknox2Q8BG99 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pknox2Q8BG99 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pknox2Q8BG99 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pknox2Q8BG99 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pknox2Q8BG99 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pknox2Q8BG99 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pknox2Q8BG99 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pknox2Q8BG99 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pknox2Q8BG99 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pknox2Q8BG99 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pknox2Q8BG99 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pknox2Q8BG99 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pknox2Q8BG99 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pknox2Q8BG99 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pknox2Q8BG99 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pknox2Q8BG99 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pknox2Q8BG99 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pknox2Q8BG99 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pknox2Q8BG99 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pknox2Q8BG99 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pknox2Q8BG99 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pknox2Q8BG99 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pknox2Q8BG99 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pknox2Q8BG99 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pknox2Q8BG99 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms