Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmtc4Q8BG19 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmtc4Q8BG19 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmtc4Q8BG19 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmtc4Q8BG19 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms