Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atg4cQ811C2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atg4cQ811C2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg4cQ811C2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg4cQ811C2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg4cQ811C2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg4cQ811C2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg4cQ811C2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atg4cQ811C2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg4cQ811C2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg4cQ811C2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg4cQ811C2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg4cQ811C2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg4cQ811C2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg4cQ811C2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4cQ811C2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4cQ811C2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg4cQ811C2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg4cQ811C2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg4cQ811C2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg4cQ811C2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg4cQ811C2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg4cQ811C2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg4cQ811C2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg4cQ811C2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg4cQ811C2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg4cQ811C2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Atg4cQ811C2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg4cQ811C2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg4cQ811C2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atg4cQ811C2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atg4cQ811C2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg4cQ811C2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg4cQ811C2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg4cQ811C2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg4cQ811C2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg4cQ811C2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg4cQ811C2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg4cQ811C2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg4cQ811C2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg4cQ811C2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg4cQ811C2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg4cQ811C2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg4cQ811C2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg4cQ811C2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg4cQ811C2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg4cQ811C2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atg4cQ811C2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg4cQ811C2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg4cQ811C2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg4cQ811C2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg4cQ811C2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg4cQ811C2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg4cQ811C2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg4cQ811C2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg4cQ811C2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg4cQ811C2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg4cQ811C2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg4cQ811C2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg4cQ811C2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg4cQ811C2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
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