Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NfascQ810U3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NfascQ810U3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NfascQ810U3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NfascQ810U3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfascQ810U3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfascQ810U3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfascQ810U3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfascQ810U3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfascQ810U3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfascQ810U3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfascQ810U3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfascQ810U3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfascQ810U3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfascQ810U3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NfascQ810U3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfascQ810U3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfascQ810U3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NfascQ810U3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfascQ810U3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfascQ810U3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfascQ810U3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfascQ810U3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfascQ810U3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfascQ810U3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfascQ810U3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfascQ810U3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfascQ810U3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfascQ810U3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfascQ810U3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfascQ810U3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NfascQ810U3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfascQ810U3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfascQ810U3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfascQ810U3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfascQ810U3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfascQ810U3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfascQ810U3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfascQ810U3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfascQ810U3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfascQ810U3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfascQ810U3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfascQ810U3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NfascQ810U3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfascQ810U3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfascQ810U3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfascQ810U3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfascQ810U3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfascQ810U3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfascQ810U3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfascQ810U3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NfascQ810U3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NfascQ810U3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfascQ810U3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfascQ810U3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfascQ810U3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfascQ810U3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfascQ810U3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfascQ810U3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfascQ810U3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfascQ810U3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfascQ810U3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfascQ810U3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfascQ810U3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfascQ810U3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfascQ810U3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfascQ810U3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfascQ810U3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfascQ810U3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfascQ810U3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfascQ810U3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NfascQ810U3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NfascQ810U3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfascQ810U3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms