Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc172Q810N9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc172Q810N9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc172Q810N9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc172Q810N9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc172Q810N9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc172Q810N9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc172Q810N9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc172Q810N9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc172Q810N9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc172Q810N9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc172Q810N9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc172Q810N9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc172Q810N9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc172Q810N9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc172Q810N9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc172Q810N9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc172Q810N9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc172Q810N9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc172Q810N9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc172Q810N9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc172Q810N9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc172Q810N9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc172Q810N9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc172Q810N9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc172Q810N9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc172Q810N9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc172Q810N9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc172Q810N9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc172Q810N9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc172Q810N9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc172Q810N9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc172Q810N9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc172Q810N9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc172Q810N9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc172Q810N9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc172Q810N9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc172Q810N9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc172Q810N9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc172Q810N9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc172Q810N9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc172Q810N9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc172Q810N9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc172Q810N9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc172Q810N9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc172Q810N9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc172Q810N9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc172Q810N9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc172Q810N9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc172Q810N9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc172Q810N9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc172Q810N9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc172Q810N9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc172Q810N9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc172Q810N9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc172Q810N9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc172Q810N9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc172Q810N9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc172Q810N9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc172Q810N9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc172Q810N9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc172Q810N9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc172Q810N9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc172Q810N9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc172Q810N9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc172Q810N9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc172Q810N9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc172Q810N9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc172Q810N9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc172Q810N9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc172Q810N9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc172Q810N9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc172Q810N9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc172Q810N9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.3 ms