Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y73

UPF0722 protein C11orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80Y73 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q80Y73 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q80Y73 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q80Y73 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q80Y73 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q80Y73 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q80Y73 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q80Y73 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q80Y73 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q80Y73 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q80Y73 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q80Y73 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Q80Y73 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q80Y73 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q80Y73 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Q80Y73 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q80Y73 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q80Y73 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q80Y73 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q80Y73 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q80Y73 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q80Y73 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q80Y73 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q80Y73 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q80Y73 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q80Y73 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q80Y73 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Q80Y73 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q80Y73 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q80Y73 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q80Y73 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q80Y73 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q80Y73 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q80Y73 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q80Y73 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q80Y73 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q80Y73 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q80Y73 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Q80Y73 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q80Y73 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q80Y73 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Q80Y73 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q80Y73 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q80Y73 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q80Y73 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q80Y73 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q80Y73 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q80Y73 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q80Y73 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q80Y73 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q80Y73 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q80Y73 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q80Y73 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q80Y73 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q80Y73 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q80Y73 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q80Y73 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q80Y73 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Q80Y73 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q80Y73 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q80Y73 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q80Y73 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q80Y73 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q80Y73 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q80Y73 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q80Y73 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q80Y73 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q80Y73 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q80Y73 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q80Y73 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q80Y73 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Q80Y73 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q80Y73 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q80Y73 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q80Y73 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q80Y73 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q80Y73 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q80Y73 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q80Y73 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q80Y73 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q80Y73 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q80Y73 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q80Y73 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Q80Y73 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q80Y73 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q80Y73 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q80Y73 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q80Y73 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q80Y73 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q80Y73 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Q80Y73 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q80Y73 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q80Y73 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q80Y73 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q80Y73 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q80Y73 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q80Y73 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q80Y73 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q80Y73 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q80Y73 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms