Protein–RNA interactions for Protein: Q80WM3

Cplx4, Complexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx4Q80WM3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cplx4Q80WM3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cplx4Q80WM3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cplx4Q80WM3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cplx4Q80WM3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cplx4Q80WM3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cplx4Q80WM3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cplx4Q80WM3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cplx4Q80WM3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cplx4Q80WM3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cplx4Q80WM3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cplx4Q80WM3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cplx4Q80WM3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cplx4Q80WM3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cplx4Q80WM3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cplx4Q80WM3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cplx4Q80WM3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cplx4Q80WM3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cplx4Q80WM3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cplx4Q80WM3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cplx4Q80WM3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cplx4Q80WM3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cplx4Q80WM3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cplx4Q80WM3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cplx4Q80WM3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cplx4Q80WM3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cplx4Q80WM3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cplx4Q80WM3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cplx4Q80WM3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 314.3 ms