Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcsk9Q80W65 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcsk9Q80W65 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcsk9Q80W65 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcsk9Q80W65 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcsk9Q80W65 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcsk9Q80W65 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcsk9Q80W65 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcsk9Q80W65 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcsk9Q80W65 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcsk9Q80W65 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcsk9Q80W65 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcsk9Q80W65 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcsk9Q80W65 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcsk9Q80W65 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcsk9Q80W65 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcsk9Q80W65 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcsk9Q80W65 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcsk9Q80W65 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcsk9Q80W65 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcsk9Q80W65 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcsk9Q80W65 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcsk9Q80W65 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcsk9Q80W65 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcsk9Q80W65 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcsk9Q80W65 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcsk9Q80W65 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcsk9Q80W65 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcsk9Q80W65 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcsk9Q80W65 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcsk9Q80W65 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcsk9Q80W65 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcsk9Q80W65 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcsk9Q80W65 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcsk9Q80W65 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcsk9Q80W65 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcsk9Q80W65 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcsk9Q80W65 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcsk9Q80W65 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcsk9Q80W65 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcsk9Q80W65 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcsk9Q80W65 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcsk9Q80W65 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcsk9Q80W65 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcsk9Q80W65 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcsk9Q80W65 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcsk9Q80W65 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcsk9Q80W65 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcsk9Q80W65 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcsk9Q80W65 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcsk9Q80W65 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcsk9Q80W65 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms