Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr2eQ80UW8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr2eQ80UW8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr2eQ80UW8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Polr2eQ80UW8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr2eQ80UW8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr2eQ80UW8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr2eQ80UW8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Polr2eQ80UW8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr2eQ80UW8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr2eQ80UW8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Polr2eQ80UW8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Polr2eQ80UW8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Polr2eQ80UW8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Polr2eQ80UW8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr2eQ80UW8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr2eQ80UW8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr2eQ80UW8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr2eQ80UW8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr2eQ80UW8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr2eQ80UW8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr2eQ80UW8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr2eQ80UW8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr2eQ80UW8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr2eQ80UW8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr2eQ80UW8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr2eQ80UW8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Polr2eQ80UW8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Polr2eQ80UW8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Polr2eQ80UW8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Polr2eQ80UW8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Polr2eQ80UW8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr2eQ80UW8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2eQ80UW8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2eQ80UW8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2eQ80UW8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2eQ80UW8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr2eQ80UW8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Polr2eQ80UW8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr2eQ80UW8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr2eQ80UW8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr2eQ80UW8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Polr2eQ80UW8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr2eQ80UW8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Polr2eQ80UW8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2eQ80UW8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2eQ80UW8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2eQ80UW8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr2eQ80UW8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr2eQ80UW8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Polr2eQ80UW8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2eQ80UW8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms