Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttll4Q80UG8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttll4Q80UG8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttll4Q80UG8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttll4Q80UG8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttll4Q80UG8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttll4Q80UG8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttll4Q80UG8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ttll4Q80UG8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ttll4Q80UG8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ttll4Q80UG8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ttll4Q80UG8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ttll4Q80UG8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ttll4Q80UG8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ttll4Q80UG8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ttll4Q80UG8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttll4Q80UG8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttll4Q80UG8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttll4Q80UG8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttll4Q80UG8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttll4Q80UG8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttll4Q80UG8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttll4Q80UG8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttll4Q80UG8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttll4Q80UG8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttll4Q80UG8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttll4Q80UG8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttll4Q80UG8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttll4Q80UG8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttll4Q80UG8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttll4Q80UG8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttll4Q80UG8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttll4Q80UG8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttll4Q80UG8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttll4Q80UG8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttll4Q80UG8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttll4Q80UG8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttll4Q80UG8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttll4Q80UG8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttll4Q80UG8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttll4Q80UG8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttll4Q80UG8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttll4Q80UG8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttll4Q80UG8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttll4Q80UG8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttll4Q80UG8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttll4Q80UG8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttll4Q80UG8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttll4Q80UG8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttll4Q80UG8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttll4Q80UG8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttll4Q80UG8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttll4Q80UG8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttll4Q80UG8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttll4Q80UG8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttll4Q80UG8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttll4Q80UG8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttll4Q80UG8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ttll4Q80UG8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttll4Q80UG8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttll4Q80UG8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttll4Q80UG8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttll4Q80UG8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttll4Q80UG8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttll4Q80UG8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttll4Q80UG8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttll4Q80UG8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttll4Q80UG8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttll4Q80UG8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttll4Q80UG8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ttll4Q80UG8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ttll4Q80UG8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ttll4Q80UG8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ttll4Q80UG8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ttll4Q80UG8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ttll4Q80UG8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttll4Q80UG8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms