Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sgo2Q7TSY8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sgo2Q7TSY8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Sgo2Q7TSY8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sgo2Q7TSY8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sgo2Q7TSY8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sgo2Q7TSY8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sgo2Q7TSY8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sgo2Q7TSY8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sgo2Q7TSY8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sgo2Q7TSY8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sgo2Q7TSY8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sgo2Q7TSY8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sgo2Q7TSY8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sgo2Q7TSY8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sgo2Q7TSY8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sgo2Q7TSY8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sgo2Q7TSY8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sgo2Q7TSY8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sgo2Q7TSY8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sgo2Q7TSY8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sgo2Q7TSY8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sgo2Q7TSY8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sgo2Q7TSY8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sgo2Q7TSY8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sgo2Q7TSY8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sgo2Q7TSY8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sgo2Q7TSY8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sgo2Q7TSY8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sgo2Q7TSY8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sgo2Q7TSY8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sgo2Q7TSY8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sgo2Q7TSY8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sgo2Q7TSY8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sgo2Q7TSY8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sgo2Q7TSY8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sgo2Q7TSY8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sgo2Q7TSY8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sgo2Q7TSY8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sgo2Q7TSY8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sgo2Q7TSY8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sgo2Q7TSY8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sgo2Q7TSY8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sgo2Q7TSY8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sgo2Q7TSY8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sgo2Q7TSY8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sgo2Q7TSY8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sgo2Q7TSY8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sgo2Q7TSY8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms