Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctdp1Q7TSG2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctdp1Q7TSG2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctdp1Q7TSG2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctdp1Q7TSG2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctdp1Q7TSG2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ctdp1Q7TSG2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctdp1Q7TSG2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctdp1Q7TSG2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctdp1Q7TSG2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctdp1Q7TSG2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctdp1Q7TSG2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctdp1Q7TSG2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctdp1Q7TSG2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctdp1Q7TSG2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctdp1Q7TSG2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctdp1Q7TSG2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ctdp1Q7TSG2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctdp1Q7TSG2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ctdp1Q7TSG2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ctdp1Q7TSG2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms