Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LnpkQ7TQ95 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LnpkQ7TQ95 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LnpkQ7TQ95 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LnpkQ7TQ95 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LnpkQ7TQ95 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LnpkQ7TQ95 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LnpkQ7TQ95 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LnpkQ7TQ95 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LnpkQ7TQ95 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LnpkQ7TQ95 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LnpkQ7TQ95 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LnpkQ7TQ95 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LnpkQ7TQ95 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LnpkQ7TQ95 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LnpkQ7TQ95 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LnpkQ7TQ95 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LnpkQ7TQ95 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LnpkQ7TQ95 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LnpkQ7TQ95 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LnpkQ7TQ95 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LnpkQ7TQ95 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LnpkQ7TQ95 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LnpkQ7TQ95 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LnpkQ7TQ95 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LnpkQ7TQ95 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LnpkQ7TQ95 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LnpkQ7TQ95 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LnpkQ7TQ95 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LnpkQ7TQ95 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LnpkQ7TQ95 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LnpkQ7TQ95 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LnpkQ7TQ95 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LnpkQ7TQ95 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LnpkQ7TQ95 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LnpkQ7TQ95 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LnpkQ7TQ95 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LnpkQ7TQ95 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LnpkQ7TQ95 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LnpkQ7TQ95 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LnpkQ7TQ95 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LnpkQ7TQ95 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LnpkQ7TQ95 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LnpkQ7TQ95 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LnpkQ7TQ95 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LnpkQ7TQ95 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LnpkQ7TQ95 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LnpkQ7TQ95 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LnpkQ7TQ95 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LnpkQ7TQ95 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LnpkQ7TQ95 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LnpkQ7TQ95 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LnpkQ7TQ95 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LnpkQ7TQ95 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LnpkQ7TQ95 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LnpkQ7TQ95 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LnpkQ7TQ95 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LnpkQ7TQ95 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LnpkQ7TQ95 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LnpkQ7TQ95 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LnpkQ7TQ95 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LnpkQ7TQ95 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LnpkQ7TQ95 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LnpkQ7TQ95 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms