Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nphp3Q7TNH6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nphp3Q7TNH6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nphp3Q7TNH6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nphp3Q7TNH6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Nphp3Q7TNH6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Nphp3Q7TNH6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nphp3Q7TNH6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nphp3Q7TNH6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nphp3Q7TNH6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nphp3Q7TNH6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nphp3Q7TNH6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nphp3Q7TNH6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nphp3Q7TNH6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nphp3Q7TNH6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nphp3Q7TNH6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nphp3Q7TNH6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nphp3Q7TNH6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Nphp3Q7TNH6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nphp3Q7TNH6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nphp3Q7TNH6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nphp3Q7TNH6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nphp3Q7TNH6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nphp3Q7TNH6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nphp3Q7TNH6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nphp3Q7TNH6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nphp3Q7TNH6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nphp3Q7TNH6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Nphp3Q7TNH6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nphp3Q7TNH6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nphp3Q7TNH6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Nphp3Q7TNH6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Nphp3Q7TNH6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nphp3Q7TNH6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nphp3Q7TNH6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nphp3Q7TNH6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nphp3Q7TNH6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nphp3Q7TNH6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nphp3Q7TNH6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Nphp3Q7TNH6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Nphp3Q7TNH6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nphp3Q7TNH6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nphp3Q7TNH6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nphp3Q7TNH6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Nphp3Q7TNH6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nphp3Q7TNH6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nphp3Q7TNH6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nphp3Q7TNH6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Nphp3Q7TNH6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nphp3Q7TNH6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nphp3Q7TNH6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nphp3Q7TNH6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Nphp3Q7TNH6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nphp3Q7TNH6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nphp3Q7TNH6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nphp3Q7TNH6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nphp3Q7TNH6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nphp3Q7TNH6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nphp3Q7TNH6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nphp3Q7TNH6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nphp3Q7TNH6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nphp3Q7TNH6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nphp3Q7TNH6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nphp3Q7TNH6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nphp3Q7TNH6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nphp3Q7TNH6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nphp3Q7TNH6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nphp3Q7TNH6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nphp3Q7TNH6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nphp3Q7TNH6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nphp3Q7TNH6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nphp3Q7TNH6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nphp3Q7TNH6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nphp3Q7TNH6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nphp3Q7TNH6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nphp3Q7TNH6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nphp3Q7TNH6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nphp3Q7TNH6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nphp3Q7TNH6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nphp3Q7TNH6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nphp3Q7TNH6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nphp3Q7TNH6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Nphp3Q7TNH6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nphp3Q7TNH6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Nphp3Q7TNH6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nphp3Q7TNH6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nphp3Q7TNH6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nphp3Q7TNH6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nphp3Q7TNH6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nphp3Q7TNH6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nphp3Q7TNH6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nphp3Q7TNH6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nphp3Q7TNH6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms