Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smap2Q7TN29 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smap2Q7TN29 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smap2Q7TN29 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smap2Q7TN29 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smap2Q7TN29 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smap2Q7TN29 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smap2Q7TN29 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smap2Q7TN29 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smap2Q7TN29 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Smap2Q7TN29 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smap2Q7TN29 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smap2Q7TN29 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smap2Q7TN29 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Smap2Q7TN29 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smap2Q7TN29 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smap2Q7TN29 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smap2Q7TN29 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smap2Q7TN29 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smap2Q7TN29 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smap2Q7TN29 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Smap2Q7TN29 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smap2Q7TN29 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smap2Q7TN29 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smap2Q7TN29 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smap2Q7TN29 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smap2Q7TN29 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smap2Q7TN29 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smap2Q7TN29 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smap2Q7TN29 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smap2Q7TN29 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smap2Q7TN29 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smap2Q7TN29 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smap2Q7TN29 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smap2Q7TN29 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smap2Q7TN29 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smap2Q7TN29 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smap2Q7TN29 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smap2Q7TN29 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms