Protein–RNA interactions for Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Rtl1Q7M732 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Rtl1Q7M732 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Rtl1Q7M732 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Rtl1Q7M732 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Rtl1Q7M732 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC42.45■■■■■ 4.39
Rtl1Q7M732 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Rtl1Q7M732 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Rtl1Q7M732 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Rtl1Q7M732 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
Rtl1Q7M732 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Rtl1Q7M732 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
Rtl1Q7M732 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Rtl1Q7M732 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Rtl1Q7M732 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Rtl1Q7M732 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
Rtl1Q7M732 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Rtl1Q7M732 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
Rtl1Q7M732 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Rtl1Q7M732 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
Rtl1Q7M732 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
Rtl1Q7M732 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Rtl1Q7M732 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Rtl1Q7M732 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
Rtl1Q7M732 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Rtl1Q7M732 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Rtl1Q7M732 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
Rtl1Q7M732 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC42.32■■■■■ 4.36
Rtl1Q7M732 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
Rtl1Q7M732 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Rtl1Q7M732 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
Rtl1Q7M732 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
Rtl1Q7M732 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Rtl1Q7M732 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Rtl1Q7M732 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Rtl1Q7M732 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
Rtl1Q7M732 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Rtl1Q7M732 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
Rtl1Q7M732 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Rtl1Q7M732 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Rtl1Q7M732 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Rtl1Q7M732 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Rtl1Q7M732 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Rtl1Q7M732 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Rtl1Q7M732 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Rtl1Q7M732 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Rtl1Q7M732 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Rtl1Q7M732 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Rtl1Q7M732 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
Rtl1Q7M732 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.33
Rtl1Q7M732 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC42.13■■■■■ 4.33
Rtl1Q7M732 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Rtl1Q7M732 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
Rtl1Q7M732 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Rtl1Q7M732 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Rtl1Q7M732 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Rtl1Q7M732 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Rtl1Q7M732 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Rtl1Q7M732 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Rtl1Q7M732 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.32
Rtl1Q7M732 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
Rtl1Q7M732 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Rtl1Q7M732 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Rtl1Q7M732 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Rtl1Q7M732 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Rtl1Q7M732 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
Rtl1Q7M732 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
Rtl1Q7M732 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
Rtl1Q7M732 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Rtl1Q7M732 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Rtl1Q7M732 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Rtl1Q7M732 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Rtl1Q7M732 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
Rtl1Q7M732 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Rtl1Q7M732 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
Rtl1Q7M732 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Rtl1Q7M732 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Rtl1Q7M732 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Rtl1Q7M732 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Rtl1Q7M732 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
Rtl1Q7M732 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Rtl1Q7M732 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
Rtl1Q7M732 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Rtl1Q7M732 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
Rtl1Q7M732 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Rtl1Q7M732 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Rtl1Q7M732 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Rtl1Q7M732 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Rtl1Q7M732 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Rtl1Q7M732 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
Rtl1Q7M732 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
Rtl1Q7M732 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
Rtl1Q7M732 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
Rtl1Q7M732 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
Rtl1Q7M732 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Rtl1Q7M732 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Rtl1Q7M732 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Rtl1Q7M732 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Rtl1Q7M732 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Rtl1Q7M732 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms