Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmed3Q78IS1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmed3Q78IS1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmed3Q78IS1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmed3Q78IS1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.4 ms