Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY9

Hist1h2bc, Histone H2B type 1-C/E/G, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h2bcQ6ZWY9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hist1h2bcQ6ZWY9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hist1h2bcQ6ZWY9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hist1h2bcQ6ZWY9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hist1h2bcQ6ZWY9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hist1h2bcQ6ZWY9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hist1h2bcQ6ZWY9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hist1h2bcQ6ZWY9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hist1h2bcQ6ZWY9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hist1h2bcQ6ZWY9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hist1h2bcQ6ZWY9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hist1h2bcQ6ZWY9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hist1h2bcQ6ZWY9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hist1h2bcQ6ZWY9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hist1h2bcQ6ZWY9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hist1h2bcQ6ZWY9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hist1h2bcQ6ZWY9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hist1h2bcQ6ZWY9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hist1h2bcQ6ZWY9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hist1h2bcQ6ZWY9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hist1h2bcQ6ZWY9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hist1h2bcQ6ZWY9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hist1h2bcQ6ZWY9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hist1h2bcQ6ZWY9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hist1h2bcQ6ZWY9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hist1h2bcQ6ZWY9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hist1h2bcQ6ZWY9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hist1h2bcQ6ZWY9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hist1h2bcQ6ZWY9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hist1h2bcQ6ZWY9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hist1h2bcQ6ZWY9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hist1h2bcQ6ZWY9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hist1h2bcQ6ZWY9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hist1h2bcQ6ZWY9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hist1h2bcQ6ZWY9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hist1h2bcQ6ZWY9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms