Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nup188Q6ZQH8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nup188Q6ZQH8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nup188Q6ZQH8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Nup188Q6ZQH8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nup188Q6ZQH8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nup188Q6ZQH8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nup188Q6ZQH8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nup188Q6ZQH8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nup188Q6ZQH8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nup188Q6ZQH8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nup188Q6ZQH8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nup188Q6ZQH8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nup188Q6ZQH8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nup188Q6ZQH8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nup188Q6ZQH8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Nup188Q6ZQH8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nup188Q6ZQH8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nup188Q6ZQH8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nup188Q6ZQH8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nup188Q6ZQH8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nup188Q6ZQH8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nup188Q6ZQH8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nup188Q6ZQH8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nup188Q6ZQH8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nup188Q6ZQH8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nup188Q6ZQH8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nup188Q6ZQH8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nup188Q6ZQH8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nup188Q6ZQH8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nup188Q6ZQH8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Nup188Q6ZQH8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nup188Q6ZQH8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Nup188Q6ZQH8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nup188Q6ZQH8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nup188Q6ZQH8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nup188Q6ZQH8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nup188Q6ZQH8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nup188Q6ZQH8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup188Q6ZQH8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nup188Q6ZQH8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nup188Q6ZQH8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup188Q6ZQH8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup188Q6ZQH8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup188Q6ZQH8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup188Q6ZQH8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nup188Q6ZQH8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup188Q6ZQH8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup188Q6ZQH8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup188Q6ZQH8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup188Q6ZQH8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup188Q6ZQH8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup188Q6ZQH8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup188Q6ZQH8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup188Q6ZQH8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup188Q6ZQH8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup188Q6ZQH8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup188Q6ZQH8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup188Q6ZQH8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup188Q6ZQH8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nup188Q6ZQH8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nup188Q6ZQH8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nup188Q6ZQH8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup188Q6ZQH8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup188Q6ZQH8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Nup188Q6ZQH8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nup188Q6ZQH8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nup188Q6ZQH8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Nup188Q6ZQH8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nup188Q6ZQH8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nup188Q6ZQH8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nup188Q6ZQH8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nup188Q6ZQH8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nup188Q6ZQH8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nup188Q6ZQH8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nup188Q6ZQH8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nup188Q6ZQH8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Nup188Q6ZQH8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nup188Q6ZQH8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms