Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NinlQ6ZQ12 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NinlQ6ZQ12 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NinlQ6ZQ12 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NinlQ6ZQ12 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
NinlQ6ZQ12 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NinlQ6ZQ12 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NinlQ6ZQ12 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NinlQ6ZQ12 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
NinlQ6ZQ12 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NinlQ6ZQ12 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NinlQ6ZQ12 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
NinlQ6ZQ12 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NinlQ6ZQ12 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NinlQ6ZQ12 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NinlQ6ZQ12 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NinlQ6ZQ12 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NinlQ6ZQ12 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NinlQ6ZQ12 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NinlQ6ZQ12 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NinlQ6ZQ12 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NinlQ6ZQ12 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NinlQ6ZQ12 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NinlQ6ZQ12 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NinlQ6ZQ12 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NinlQ6ZQ12 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NinlQ6ZQ12 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
NinlQ6ZQ12 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NinlQ6ZQ12 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NinlQ6ZQ12 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NinlQ6ZQ12 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NinlQ6ZQ12 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NinlQ6ZQ12 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NinlQ6ZQ12 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NinlQ6ZQ12 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NinlQ6ZQ12 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NinlQ6ZQ12 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NinlQ6ZQ12 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NinlQ6ZQ12 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NinlQ6ZQ12 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NinlQ6ZQ12 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NinlQ6ZQ12 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NinlQ6ZQ12 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NinlQ6ZQ12 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NinlQ6ZQ12 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NinlQ6ZQ12 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NinlQ6ZQ12 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NinlQ6ZQ12 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NinlQ6ZQ12 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NinlQ6ZQ12 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NinlQ6ZQ12 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NinlQ6ZQ12 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NinlQ6ZQ12 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NinlQ6ZQ12 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NinlQ6ZQ12 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
NinlQ6ZQ12 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NinlQ6ZQ12 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NinlQ6ZQ12 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NinlQ6ZQ12 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NinlQ6ZQ12 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NinlQ6ZQ12 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NinlQ6ZQ12 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NinlQ6ZQ12 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NinlQ6ZQ12 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NinlQ6ZQ12 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NinlQ6ZQ12 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NinlQ6ZQ12 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC32.07■■■□□ 2.73
NinlQ6ZQ12 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NinlQ6ZQ12 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NinlQ6ZQ12 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NinlQ6ZQ12 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NinlQ6ZQ12 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NinlQ6ZQ12 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NinlQ6ZQ12 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NinlQ6ZQ12 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NinlQ6ZQ12 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NinlQ6ZQ12 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NinlQ6ZQ12 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NinlQ6ZQ12 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NinlQ6ZQ12 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NinlQ6ZQ12 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NinlQ6ZQ12 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NinlQ6ZQ12 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NinlQ6ZQ12 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC32■■■□□ 2.71
NinlQ6ZQ12 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NinlQ6ZQ12 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
NinlQ6ZQ12 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NinlQ6ZQ12 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NinlQ6ZQ12 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NinlQ6ZQ12 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NinlQ6ZQ12 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NinlQ6ZQ12 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NinlQ6ZQ12 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NinlQ6ZQ12 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms