Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smg5Q6ZPY2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smg5Q6ZPY2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smg5Q6ZPY2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg5Q6ZPY2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg5Q6ZPY2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg5Q6ZPY2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg5Q6ZPY2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg5Q6ZPY2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smg5Q6ZPY2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smg5Q6ZPY2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smg5Q6ZPY2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smg5Q6ZPY2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smg5Q6ZPY2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smg5Q6ZPY2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smg5Q6ZPY2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smg5Q6ZPY2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smg5Q6ZPY2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smg5Q6ZPY2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smg5Q6ZPY2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Smg5Q6ZPY2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg5Q6ZPY2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg5Q6ZPY2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smg5Q6ZPY2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smg5Q6ZPY2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smg5Q6ZPY2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg5Q6ZPY2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg5Q6ZPY2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg5Q6ZPY2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg5Q6ZPY2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg5Q6ZPY2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smg5Q6ZPY2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg5Q6ZPY2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smg5Q6ZPY2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg5Q6ZPY2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg5Q6ZPY2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg5Q6ZPY2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smg5Q6ZPY2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg5Q6ZPY2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg5Q6ZPY2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg5Q6ZPY2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smg5Q6ZPY2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smg5Q6ZPY2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms