Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LcorQ6ZPI3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LcorQ6ZPI3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LcorQ6ZPI3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LcorQ6ZPI3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LcorQ6ZPI3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LcorQ6ZPI3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LcorQ6ZPI3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LcorQ6ZPI3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LcorQ6ZPI3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LcorQ6ZPI3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LcorQ6ZPI3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LcorQ6ZPI3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LcorQ6ZPI3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LcorQ6ZPI3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LcorQ6ZPI3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LcorQ6ZPI3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LcorQ6ZPI3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LcorQ6ZPI3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LcorQ6ZPI3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LcorQ6ZPI3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LcorQ6ZPI3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LcorQ6ZPI3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LcorQ6ZPI3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LcorQ6ZPI3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LcorQ6ZPI3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LcorQ6ZPI3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LcorQ6ZPI3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LcorQ6ZPI3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LcorQ6ZPI3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LcorQ6ZPI3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LcorQ6ZPI3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LcorQ6ZPI3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LcorQ6ZPI3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LcorQ6ZPI3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LcorQ6ZPI3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LcorQ6ZPI3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LcorQ6ZPI3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LcorQ6ZPI3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LcorQ6ZPI3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LcorQ6ZPI3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LcorQ6ZPI3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LcorQ6ZPI3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LcorQ6ZPI3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LcorQ6ZPI3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LcorQ6ZPI3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LcorQ6ZPI3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LcorQ6ZPI3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LcorQ6ZPI3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LcorQ6ZPI3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LcorQ6ZPI3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LcorQ6ZPI3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LcorQ6ZPI3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LcorQ6ZPI3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LcorQ6ZPI3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LcorQ6ZPI3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms