Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Glis3Q6XP49 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Glis3Q6XP49 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Glis3Q6XP49 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Glis3Q6XP49 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Glis3Q6XP49 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Glis3Q6XP49 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Glis3Q6XP49 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
Glis3Q6XP49 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Glis3Q6XP49 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Glis3Q6XP49 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Glis3Q6XP49 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Glis3Q6XP49 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
Glis3Q6XP49 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Glis3Q6XP49 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Glis3Q6XP49 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Glis3Q6XP49 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Glis3Q6XP49 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Glis3Q6XP49 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Glis3Q6XP49 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Glis3Q6XP49 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Glis3Q6XP49 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Glis3Q6XP49 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Glis3Q6XP49 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Glis3Q6XP49 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Glis3Q6XP49 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Glis3Q6XP49 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Glis3Q6XP49 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Glis3Q6XP49 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Glis3Q6XP49 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Glis3Q6XP49 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Glis3Q6XP49 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Glis3Q6XP49 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Glis3Q6XP49 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28,31■■■□□ 2,12
Glis3Q6XP49 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Glis3Q6XP49 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Glis3Q6XP49 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Glis3Q6XP49 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Glis3Q6XP49 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Glis3Q6XP49 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Glis3Q6XP49 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Glis3Q6XP49 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Glis3Q6XP49 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Glis3Q6XP49 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Glis3Q6XP49 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Glis3Q6XP49 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Glis3Q6XP49 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Glis3Q6XP49 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Glis3Q6XP49 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Glis3Q6XP49 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Glis3Q6XP49 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Glis3Q6XP49 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Glis3Q6XP49 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Glis3Q6XP49 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Glis3Q6XP49 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
Glis3Q6XP49 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Glis3Q6XP49 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Glis3Q6XP49 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Glis3Q6XP49 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Glis3Q6XP49 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Glis3Q6XP49 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Glis3Q6XP49 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Glis3Q6XP49 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Glis3Q6XP49 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Glis3Q6XP49 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Glis3Q6XP49 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Glis3Q6XP49 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Glis3Q6XP49 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Glis3Q6XP49 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Glis3Q6XP49 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Glis3Q6XP49 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Glis3Q6XP49 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Glis3Q6XP49 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28,15■■■□□ 2,1
Glis3Q6XP49 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Glis3Q6XP49 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28,14■■■□□ 2,1
Glis3Q6XP49 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,09
Glis3Q6XP49 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Glis3Q6XP49 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Glis3Q6XP49 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Glis3Q6XP49 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Glis3Q6XP49 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28,12■■■□□ 2,09
Glis3Q6XP49 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Glis3Q6XP49 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Glis3Q6XP49 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Glis3Q6XP49 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Glis3Q6XP49 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Glis3Q6XP49 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Glis3Q6XP49 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Glis3Q6XP49 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Glis3Q6XP49 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Glis3Q6XP49 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Glis3Q6XP49 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Glis3Q6XP49 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Glis3Q6XP49 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Glis3Q6XP49 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
Glis3Q6XP49 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Glis3Q6XP49 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28,07■■■□□ 2,08
Glis3Q6XP49 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Glis3Q6XP49 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Glis3Q6XP49 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37,9 ms