Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gja6Q6S5G4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Gja6Q6S5G4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gja6Q6S5G4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gja6Q6S5G4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gja6Q6S5G4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gja6Q6S5G4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gja6Q6S5G4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gja6Q6S5G4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gja6Q6S5G4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gja6Q6S5G4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gja6Q6S5G4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gja6Q6S5G4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gja6Q6S5G4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gja6Q6S5G4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gja6Q6S5G4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gja6Q6S5G4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gja6Q6S5G4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gja6Q6S5G4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gja6Q6S5G4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gja6Q6S5G4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Gja6Q6S5G4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gja6Q6S5G4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gja6Q6S5G4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gja6Q6S5G4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gja6Q6S5G4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gja6Q6S5G4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gja6Q6S5G4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gja6Q6S5G4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gja6Q6S5G4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gja6Q6S5G4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gja6Q6S5G4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Gja6Q6S5G4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gja6Q6S5G4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gja6Q6S5G4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gja6Q6S5G4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Gja6Q6S5G4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gja6Q6S5G4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gja6Q6S5G4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gja6Q6S5G4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gja6Q6S5G4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gja6Q6S5G4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gja6Q6S5G4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gja6Q6S5G4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gja6Q6S5G4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gja6Q6S5G4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja6Q6S5G4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja6Q6S5G4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja6Q6S5G4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja6Q6S5G4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Gja6Q6S5G4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Gja6Q6S5G4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gja6Q6S5G4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gja6Q6S5G4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gja6Q6S5G4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gja6Q6S5G4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gja6Q6S5G4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gja6Q6S5G4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gja6Q6S5G4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms