Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Krt9Q6RHW0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt9Q6RHW0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt9Q6RHW0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Krt9Q6RHW0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt9Q6RHW0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt9Q6RHW0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt9Q6RHW0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt9Q6RHW0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt9Q6RHW0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Krt9Q6RHW0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Krt9Q6RHW0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Krt9Q6RHW0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt9Q6RHW0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt9Q6RHW0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt9Q6RHW0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Krt9Q6RHW0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt9Q6RHW0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt9Q6RHW0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt9Q6RHW0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt9Q6RHW0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt9Q6RHW0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt9Q6RHW0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt9Q6RHW0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt9Q6RHW0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Krt9Q6RHW0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt9Q6RHW0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Krt9Q6RHW0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Krt9Q6RHW0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt9Q6RHW0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt9Q6RHW0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt9Q6RHW0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt9Q6RHW0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Krt9Q6RHW0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt9Q6RHW0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt9Q6RHW0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt9Q6RHW0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt9Q6RHW0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt9Q6RHW0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt9Q6RHW0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt9Q6RHW0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt9Q6RHW0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt9Q6RHW0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt9Q6RHW0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt9Q6RHW0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt9Q6RHW0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt9Q6RHW0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt9Q6RHW0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt9Q6RHW0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt9Q6RHW0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt9Q6RHW0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms