Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5P0

Tlr11, Toll-like receptor 11, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr11Q6R5P0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tlr11Q6R5P0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tlr11Q6R5P0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlr11Q6R5P0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlr11Q6R5P0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tlr11Q6R5P0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr11Q6R5P0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr11Q6R5P0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tlr11Q6R5P0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tlr11Q6R5P0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tlr11Q6R5P0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tlr11Q6R5P0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlr11Q6R5P0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlr11Q6R5P0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlr11Q6R5P0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tlr11Q6R5P0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tlr11Q6R5P0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tlr11Q6R5P0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tlr11Q6R5P0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tlr11Q6R5P0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tlr11Q6R5P0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tlr11Q6R5P0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tlr11Q6R5P0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tlr11Q6R5P0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tlr11Q6R5P0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tlr11Q6R5P0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tlr11Q6R5P0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tlr11Q6R5P0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tlr11Q6R5P0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tlr11Q6R5P0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tlr11Q6R5P0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tlr11Q6R5P0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tlr11Q6R5P0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tlr11Q6R5P0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tlr11Q6R5P0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tlr11Q6R5P0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tlr11Q6R5P0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tlr11Q6R5P0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tlr11Q6R5P0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tlr11Q6R5P0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tlr11Q6R5P0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tlr11Q6R5P0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tlr11Q6R5P0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tlr11Q6R5P0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlr11Q6R5P0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlr11Q6R5P0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr11Q6R5P0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr11Q6R5P0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr11Q6R5P0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr11Q6R5P0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr11Q6R5P0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr11Q6R5P0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr11Q6R5P0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr11Q6R5P0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr11Q6R5P0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tlr11Q6R5P0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tlr11Q6R5P0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tlr11Q6R5P0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr11Q6R5P0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr11Q6R5P0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlr11Q6R5P0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlr11Q6R5P0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlr11Q6R5P0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tlr11Q6R5P0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tlr11Q6R5P0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tlr11Q6R5P0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tlr11Q6R5P0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tlr11Q6R5P0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tlr11Q6R5P0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tlr11Q6R5P0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tlr11Q6R5P0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tlr11Q6R5P0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tlr11Q6R5P0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tlr11Q6R5P0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr11Q6R5P0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr11Q6R5P0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr11Q6R5P0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr11Q6R5P0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr11Q6R5P0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr11Q6R5P0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlr11Q6R5P0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr11Q6R5P0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr11Q6R5P0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr11Q6R5P0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr11Q6R5P0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr11Q6R5P0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr11Q6R5P0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr11Q6R5P0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlr11Q6R5P0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlr11Q6R5P0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlr11Q6R5P0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlr11Q6R5P0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlr11Q6R5P0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlr11Q6R5P0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tlr11Q6R5P0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tlr11Q6R5P0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tlr11Q6R5P0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tlr11Q6R5P0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tlr11Q6R5P0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tlr11Q6R5P0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 529.3 ms