Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIX5

Rhbdf1, Inactive rhomboid protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdf1Q6PIX5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rhbdf1Q6PIX5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhbdf1Q6PIX5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rhbdf1Q6PIX5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rhbdf1Q6PIX5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rhbdf1Q6PIX5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rhbdf1Q6PIX5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhbdf1Q6PIX5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhbdf1Q6PIX5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhbdf1Q6PIX5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhbdf1Q6PIX5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhbdf1Q6PIX5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhbdf1Q6PIX5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhbdf1Q6PIX5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhbdf1Q6PIX5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rhbdf1Q6PIX5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rhbdf1Q6PIX5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rhbdf1Q6PIX5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rhbdf1Q6PIX5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rhbdf1Q6PIX5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhbdf1Q6PIX5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhbdf1Q6PIX5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhbdf1Q6PIX5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhbdf1Q6PIX5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhbdf1Q6PIX5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhbdf1Q6PIX5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhbdf1Q6PIX5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhbdf1Q6PIX5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhbdf1Q6PIX5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhbdf1Q6PIX5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rhbdf1Q6PIX5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rhbdf1Q6PIX5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rhbdf1Q6PIX5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rhbdf1Q6PIX5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rhbdf1Q6PIX5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rhbdf1Q6PIX5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rhbdf1Q6PIX5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rhbdf1Q6PIX5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rhbdf1Q6PIX5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rhbdf1Q6PIX5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rhbdf1Q6PIX5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rhbdf1Q6PIX5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rhbdf1Q6PIX5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rhbdf1Q6PIX5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rhbdf1Q6PIX5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rhbdf1Q6PIX5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rhbdf1Q6PIX5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rhbdf1Q6PIX5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rhbdf1Q6PIX5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rhbdf1Q6PIX5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rhbdf1Q6PIX5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rhbdf1Q6PIX5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rhbdf1Q6PIX5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rhbdf1Q6PIX5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rhbdf1Q6PIX5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rhbdf1Q6PIX5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rhbdf1Q6PIX5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rhbdf1Q6PIX5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rhbdf1Q6PIX5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rhbdf1Q6PIX5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rhbdf1Q6PIX5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rhbdf1Q6PIX5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rhbdf1Q6PIX5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rhbdf1Q6PIX5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rhbdf1Q6PIX5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rhbdf1Q6PIX5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rhbdf1Q6PIX5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rhbdf1Q6PIX5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rhbdf1Q6PIX5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rhbdf1Q6PIX5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rhbdf1Q6PIX5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rhbdf1Q6PIX5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rhbdf1Q6PIX5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rhbdf1Q6PIX5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rhbdf1Q6PIX5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rhbdf1Q6PIX5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rhbdf1Q6PIX5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rhbdf1Q6PIX5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rhbdf1Q6PIX5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rhbdf1Q6PIX5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rhbdf1Q6PIX5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rhbdf1Q6PIX5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rhbdf1Q6PIX5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rhbdf1Q6PIX5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rhbdf1Q6PIX5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rhbdf1Q6PIX5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rhbdf1Q6PIX5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rhbdf1Q6PIX5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rhbdf1Q6PIX5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rhbdf1Q6PIX5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rhbdf1Q6PIX5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rhbdf1Q6PIX5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rhbdf1Q6PIX5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rhbdf1Q6PIX5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rhbdf1Q6PIX5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rhbdf1Q6PIX5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rhbdf1Q6PIX5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhbdf1Q6PIX5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rhbdf1Q6PIX5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rhbdf1Q6PIX5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms