Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna2d2Q6PHS9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna2d2Q6PHS9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna2d2Q6PHS9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna2d2Q6PHS9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna2d2Q6PHS9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna2d2Q6PHS9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna2d2Q6PHS9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna2d2Q6PHS9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna2d2Q6PHS9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna2d2Q6PHS9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna2d2Q6PHS9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cacna2d2Q6PHS9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cacna2d2Q6PHS9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cacna2d2Q6PHS9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna2d2Q6PHS9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cacna2d2Q6PHS9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna2d2Q6PHS9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna2d2Q6PHS9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna2d2Q6PHS9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna2d2Q6PHS9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna2d2Q6PHS9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna2d2Q6PHS9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna2d2Q6PHS9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna2d2Q6PHS9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna2d2Q6PHS9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna2d2Q6PHS9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna2d2Q6PHS9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna2d2Q6PHS9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna2d2Q6PHS9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacna2d2Q6PHS9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms