Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc85bQ6PDY0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc85bQ6PDY0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc85bQ6PDY0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc85bQ6PDY0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc85bQ6PDY0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc85bQ6PDY0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc85bQ6PDY0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc85bQ6PDY0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc85bQ6PDY0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc85bQ6PDY0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc85bQ6PDY0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc85bQ6PDY0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc85bQ6PDY0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc85bQ6PDY0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc85bQ6PDY0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc85bQ6PDY0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc85bQ6PDY0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc85bQ6PDY0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc85bQ6PDY0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc85bQ6PDY0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc85bQ6PDY0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc85bQ6PDY0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc85bQ6PDY0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc85bQ6PDY0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc85bQ6PDY0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc85bQ6PDY0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85bQ6PDY0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85bQ6PDY0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc85bQ6PDY0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc85bQ6PDY0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc85bQ6PDY0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc85bQ6PDY0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc85bQ6PDY0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc85bQ6PDY0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc85bQ6PDY0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc85bQ6PDY0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc85bQ6PDY0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc85bQ6PDY0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc85bQ6PDY0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc85bQ6PDY0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc85bQ6PDY0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85bQ6PDY0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85bQ6PDY0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms