Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sarm1Q6PDS3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sarm1Q6PDS3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sarm1Q6PDS3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sarm1Q6PDS3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sarm1Q6PDS3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sarm1Q6PDS3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sarm1Q6PDS3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sarm1Q6PDS3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sarm1Q6PDS3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sarm1Q6PDS3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sarm1Q6PDS3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sarm1Q6PDS3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sarm1Q6PDS3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sarm1Q6PDS3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sarm1Q6PDS3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sarm1Q6PDS3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sarm1Q6PDS3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sarm1Q6PDS3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sarm1Q6PDS3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sarm1Q6PDS3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sarm1Q6PDS3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sarm1Q6PDS3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sarm1Q6PDS3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sarm1Q6PDS3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sarm1Q6PDS3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sarm1Q6PDS3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sarm1Q6PDS3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sarm1Q6PDS3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sarm1Q6PDS3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sarm1Q6PDS3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sarm1Q6PDS3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sarm1Q6PDS3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sarm1Q6PDS3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sarm1Q6PDS3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sarm1Q6PDS3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sarm1Q6PDS3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sarm1Q6PDS3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sarm1Q6PDS3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sarm1Q6PDS3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sarm1Q6PDS3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sarm1Q6PDS3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sarm1Q6PDS3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sarm1Q6PDS3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sarm1Q6PDS3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sarm1Q6PDS3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sarm1Q6PDS3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sarm1Q6PDS3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sarm1Q6PDS3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sarm1Q6PDS3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sarm1Q6PDS3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sarm1Q6PDS3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sarm1Q6PDS3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sarm1Q6PDS3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sarm1Q6PDS3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sarm1Q6PDS3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sarm1Q6PDS3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sarm1Q6PDS3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sarm1Q6PDS3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sarm1Q6PDS3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sarm1Q6PDS3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sarm1Q6PDS3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sarm1Q6PDS3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sarm1Q6PDS3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sarm1Q6PDS3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sarm1Q6PDS3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sarm1Q6PDS3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sarm1Q6PDS3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sarm1Q6PDS3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sarm1Q6PDS3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sarm1Q6PDS3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sarm1Q6PDS3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sarm1Q6PDS3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sarm1Q6PDS3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sarm1Q6PDS3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sarm1Q6PDS3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms