Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S0

Mtss1l, MTSS1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtss1lQ6P9S0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mtss1lQ6P9S0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mtss1lQ6P9S0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mtss1lQ6P9S0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mtss1lQ6P9S0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mtss1lQ6P9S0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mtss1lQ6P9S0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mtss1lQ6P9S0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mtss1lQ6P9S0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mtss1lQ6P9S0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mtss1lQ6P9S0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mtss1lQ6P9S0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mtss1lQ6P9S0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mtss1lQ6P9S0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mtss1lQ6P9S0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mtss1lQ6P9S0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mtss1lQ6P9S0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Mtss1lQ6P9S0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Mtss1lQ6P9S0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mtss1lQ6P9S0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mtss1lQ6P9S0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mtss1lQ6P9S0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mtss1lQ6P9S0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mtss1lQ6P9S0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mtss1lQ6P9S0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mtss1lQ6P9S0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Mtss1lQ6P9S0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mtss1lQ6P9S0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mtss1lQ6P9S0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mtss1lQ6P9S0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mtss1lQ6P9S0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mtss1lQ6P9S0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mtss1lQ6P9S0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mtss1lQ6P9S0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mtss1lQ6P9S0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mtss1lQ6P9S0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mtss1lQ6P9S0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Mtss1lQ6P9S0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mtss1lQ6P9S0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Mtss1lQ6P9S0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mtss1lQ6P9S0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mtss1lQ6P9S0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mtss1lQ6P9S0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mtss1lQ6P9S0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mtss1lQ6P9S0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mtss1lQ6P9S0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mtss1lQ6P9S0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mtss1lQ6P9S0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mtss1lQ6P9S0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mtss1lQ6P9S0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mtss1lQ6P9S0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mtss1lQ6P9S0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mtss1lQ6P9S0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mtss1lQ6P9S0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mtss1lQ6P9S0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mtss1lQ6P9S0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mtss1lQ6P9S0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Mtss1lQ6P9S0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mtss1lQ6P9S0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mtss1lQ6P9S0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mtss1lQ6P9S0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mtss1lQ6P9S0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mtss1lQ6P9S0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mtss1lQ6P9S0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mtss1lQ6P9S0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mtss1lQ6P9S0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mtss1lQ6P9S0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mtss1lQ6P9S0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mtss1lQ6P9S0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mtss1lQ6P9S0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mtss1lQ6P9S0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mtss1lQ6P9S0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mtss1lQ6P9S0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mtss1lQ6P9S0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mtss1lQ6P9S0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mtss1lQ6P9S0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mtss1lQ6P9S0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mtss1lQ6P9S0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms