Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC061212Q6P8K3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BC061212Q6P8K3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BC061212Q6P8K3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BC061212Q6P8K3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BC061212Q6P8K3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms