Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam222bQ6P539 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam222bQ6P539 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam222bQ6P539 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam222bQ6P539 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms