Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4P1

Serpina3a, Serine protease inhibitor A3A, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina3aQ6P4P1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Serpina3aQ6P4P1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Serpina3aQ6P4P1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Serpina3aQ6P4P1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serpina3aQ6P4P1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serpina3aQ6P4P1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serpina3aQ6P4P1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serpina3aQ6P4P1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Serpina3aQ6P4P1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Serpina3aQ6P4P1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Serpina3aQ6P4P1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Serpina3aQ6P4P1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Serpina3aQ6P4P1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Serpina3aQ6P4P1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Serpina3aQ6P4P1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Serpina3aQ6P4P1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Serpina3aQ6P4P1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Serpina3aQ6P4P1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Serpina3aQ6P4P1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Serpina3aQ6P4P1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Serpina3aQ6P4P1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Serpina3aQ6P4P1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Serpina3aQ6P4P1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Serpina3aQ6P4P1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Serpina3aQ6P4P1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Serpina3aQ6P4P1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Serpina3aQ6P4P1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serpina3aQ6P4P1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Serpina3aQ6P4P1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serpina3aQ6P4P1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serpina3aQ6P4P1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serpina3aQ6P4P1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Serpina3aQ6P4P1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Serpina3aQ6P4P1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina3aQ6P4P1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina3aQ6P4P1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina3aQ6P4P1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina3aQ6P4P1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina3aQ6P4P1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina3aQ6P4P1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina3aQ6P4P1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina3aQ6P4P1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serpina3aQ6P4P1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serpina3aQ6P4P1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms