Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc189Q6NZQ0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc189Q6NZQ0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc189Q6NZQ0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc189Q6NZQ0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc189Q6NZQ0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc189Q6NZQ0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc189Q6NZQ0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc189Q6NZQ0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc189Q6NZQ0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc189Q6NZQ0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc189Q6NZQ0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc189Q6NZQ0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc189Q6NZQ0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc189Q6NZQ0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc189Q6NZQ0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc189Q6NZQ0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc189Q6NZQ0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc189Q6NZQ0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc189Q6NZQ0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc189Q6NZQ0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc189Q6NZQ0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc189Q6NZQ0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc189Q6NZQ0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc189Q6NZQ0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc189Q6NZQ0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc189Q6NZQ0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc189Q6NZQ0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc189Q6NZQ0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc189Q6NZQ0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc189Q6NZQ0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc189Q6NZQ0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc189Q6NZQ0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc189Q6NZQ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc189Q6NZQ0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc189Q6NZQ0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc189Q6NZQ0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc189Q6NZQ0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc189Q6NZQ0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc189Q6NZQ0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc189Q6NZQ0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc189Q6NZQ0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc189Q6NZQ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc189Q6NZQ0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc189Q6NZQ0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc189Q6NZQ0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms